國際有機農業和有機農產品的法規與管理體系主要分為三個層次，一是聯合國層次，二是國際性非政府組織層次，三是國家層次。
聯合國層次的有機農業和有機農產品標準是由聯合國糧農組織（FAO）與世界衛生組織（WHO）制定的，是“食品法典”的一部分，目前尚屬于建議性標準。我國作為聯合國成員國也參與了標準制定。“食品法典”作為聯合國協調各個成員國食品衛生和質量標準的跨國性標準，一旦成為強制性標準，就可以作為WTO仲裁國際食品生產和貿易糾紛的依據。“食品法典”的標準結構、體系和內容等基本上參考了歐盟有機農業標準U2092/91以及國際有機農業運動聯盟（IFOAM）的“基本標準”。
國際有機農業運動聯盟的基本標準屬于非政府組織制定的有機農業標準，盡管它屬于非政府標準，但其影響卻非常大甚至超過國家標準。國際有機農業運動聯盟成立于1972年，到目前已經有110多個國家700多個會員組織。它的優勢在于聯合國際上從事有機農業生產、加工和研究的各類組織和個人，其制定的標準具有廣泛的民主性和代表性，因此許多國家在制定有機農業標準時參考IFOAM的基本標準，甚至FAO在制定標準時也專門邀請了IFOAM參與制定。
國家層次的有機農業標準以歐盟、美國和日本為代表，其中目前已經制定完畢且生效的是歐盟的有機農業條例EU2092/91及其修改條款。歐盟標準適用于其15個成員國的所有有機農產品的生產、加工、貿易包括進口和出口。也就是說，所有進口到歐盟的有機農產品的生產過程應該符合歐盟的有機農業標準。因此，歐盟標準制定完成后，對世界其他國家的有機農產品生產、管理，特別是貿易產生了很大影響。
以歐盟標準為范本，美國和日本也加緊了標準制定。1990年，美國頒布了“有機農產品生產法案”，并成立了國際有機農業標準委員會（NOSB），由美國農業部市場司歸口領導。美國的有機標準基本上與歐盟的類似，區別在于美國的標準把檢查、認證等完整地列入。美國有機農業標準于2001年2月20日開始試行。2002年8月正式執行。日本2000年4月份推出了有機農業標準，具體內容與歐盟95%以上是相似的。該標準于2001年4月正式執行。
