平時在飯后飲用正山小種對腸胃很好，可以起到促進消化、保護胃黏膜、養胃暖胃的效果。腸胃不太好的人可以選擇喝正山小種來調理腸胃，和糖、牛奶一起搭配飲用時還可以輔助治療腸胃潰瘍和炎癥。
這是因為正山小種屬于紅茶，紅茶中的茶多酚含量極少。茶多酚具有收斂的性質，會刺激胃黏膜，因此空腹的時候喝綠茶等富含茶多酚的茶葉時容易傷胃，引起腸胃不適反應。
不過，正山小種養胃還是傷胃也取決于是否喝對了方法。喝淡茶、熱茶會有養胃的作用，而濃茶中的茶多酚含量會增多，所以喝較濃或涼了的正山小種不但會影響暖胃效果，甚至會刺激和傷害腸胃。
沖泡正山小種紅茶的關鍵是以懸壺高沖手法，注入90度的開水，頭泡茶前需要溫杯。正山小種不適合長時間浸泡，第一泡茶可以在5秒內出水，不宜超過10秒。2～3泡的時間不宜超過半分鐘，后幾泡時間可以稍微延長，但也不宜超過一分鐘。
